tmhmm(土命和木命合不合)
<h2>请生物高手帮我分析一下,蛋白用TMHMM分析跨膜区,可结果我看不懂h2>
你这个结果很明显。 然后是最简单的结果。 无跨膜区,蛋白质均在膜外。 你也可以看到,曲线的纵轴是概率,横轴是序列,共有2193AA,红色表示跨膜区,几乎有5%的概率,蓝色的inside在膜内部,概率极低; 相反,紫色细线表示在膜外的概率,几乎为100%。 结论1至2193均为outside
<h2>蛋白质跨膜区分析的意义h2>
意味着膜蛋白固定在细胞膜上,所有跨膜区都具有这一功能。 但是,由于不同的跨膜部位有其自身的功能,不同蛋白质跨膜部位的功能既有相同的部分,也有不同的部分。
蛋白质含有跨膜区,提示其可能是膜受体,或定位于膜上的膜蛋白的膜蛋白或离子通道蛋白。
首先,研究文献介绍了一种在确定两种蛋白质之间存在相互作用后再寻找结构域的方法。 有晶体衍射相互作用结构域的报道,需要仔细研究目标蛋白质的三级结构,如螺旋、切片蛋白质起始和终止部位的确定等。 常用的是酵母。
蛋白质序列中跨细胞膜的区域通常为-螺旋结构,约20~25个氨基酸残基。 构成他蛋白质的氨基酸大部分是疏水性氨基酸。
跨膜蛋白的分析多采用TMHMM软件进行。
膜蛋白以螺旋形式单次或多次穿透膜。 跨膜蛋白质大部分以螺旋结构横跨脂双层。 部分多肽链一次通过单个螺旋脂质双层,单个跨膜蛋白质部分多肽链多次通过螺旋脂质双层,多次为跨膜蛋白质。 跨膜蛋白质疏水区在脂双层内与脂分子疏水尾部相互作用,亲水区暴露于膜两侧。